pyspark之填充缺失的时间数据

这里的场景是，原始数据有两个表示时间的字段：日期和小时，以及对应时间的数据值(比如某个网站的访问量，在凌晨一般没有，白天有)。只有数据值不为0的时候才会记录，因此数据值为0的时间段是没有的。但我们可能需要这些数据，因此就要用到填充功能。

下面会举一个例子来说明。

首先导入需要用到的包，这里的pyspark版本是2.2.0，python版本是2.7。

import sys
reload(sys)
sys.setdefaultencoding('utf-8')
from pyspark.sql import SparkSession, SQLContext
import pyspark.sql.functions as F
from pyspark.sql.types import *
from pyspark.sql.window import Window

创建一个spark会话（如果使用的是shell，不需要此步骤）：

spark = SparkSession.builder.appName("test").enableHiveSupport().getOrCreate()

创建一个dataframe，有5列6行数据：

df = spark.createDataFrame(
    [(1, "a", 10, "2019-09-20", "1"), (2, "a", 20, "2019-09-20", "3"), (3, "a", 5, "2019-09-21", "5"), (4, "b", 8, "2019-09-20", "7"), (5, "b", 9, "2019-09-21", "9"), (6, "b", 16, "2019-09-21", "11")], 
    ["id", "category", "num", "d", "h"])

原始数据表示时间的两列是日期(d)和小时(h)，将其转换为时间戳，在此之前，先将h列转换成整数类型：

df = df.withColumn("h", df["h"].cast(IntegerType()))
df = df.withColumn("time", F.from_unixtime((F.unix_timestamp(F.col("d"), "yyyy-MM-dd")+F.col("h")*3600)).cast("timestamp"))

看一看数据：

输出：

可以发现，time列显示的时间并不是我们希望得到的时间，不过没关系，这个不影响我们数据的填充。

下面介绍两种方法来填充数据。

第一种方法，根据数据中的最小时间和最大时间，生成这个时间段的所有时间数据，再和原始表做left outer join。

先获取最小时间和最大时间

根据最小时间和最大时间，以小时为单位，生成这个时间段的所有时间数据：

输出：

这里有两个category，a和b，假如我们希望对于每个category，都有完整的时间数据，要怎么做呢？那就要用到笛卡尔积了：

笛卡尔积的结果就是所有我们需要的时间段数据，再将其与原始表做left outer join，就能得到我们想要的结果

此时df1的前几行是这样的：

发现填充的数据的id，num，d，h都是空的，那么就需要补充这些数据的值了：

再来看看df1的前5行：

可以发现，转换为d和h后，时间就变成我们想要的了，time和d、h看起来不是一个时间。。。事实上，写入hive表后，time也会变成我们想要的时间，这里显示的时间不准确，可能是有别的未可知原因。

用df1.count()查看，有70列数据。可以想一下，为什么是70行。

方法一需要生成所有category的所有时间段的数据，再和原始表join，在数据量很大的时候，效率比较低。方法二则是生成原始表所没有的数据，再和原始表做union。

方法二的主要思想是，通过每个category下time的排序，找出相邻两个time之间的缺失time，然后生成缺失time的数据。

首先针对每个category下的数据，得到该行数据对应的time的上一个已有的time：

得到此时间与上一个时间的时间差：

这里的时间差是以秒为单位的，当时间差为3600秒时，说明两个时间之间没有缺失的时间，大于3600秒时才有。因此，要针对这部分数据找出缺失的时间：

这里的fill_dates是一个udf函数，输入当前时间x，以及时间差z，以3600秒为步长，得到当前时间与上一个时间之间缺失的那些时间，即这里的next_dates，它是一个list。可以用explode函数将这个list拆分，得到多行数据：

再做一些格式转换，以及d和h的生成，num和id的补充：

看两行数据：

next_dates是时间戳格式。

再将这个表和原始表union一下就好了，注意要drop不需要的列：

输出：

df2.count()后发现只有58行。

原来这里会针对每个category有一个最大时间和最小时间，所以得到的结果数是比方法一少的。疏忽了！

如果想得到和方法一一样的结果，可以这么写：

先针对每个category，生成最小时间和最大时间的数据。这里有两个category，所以会有2*2=4行数据

输出：

然后将生成的数据和原始表left join，得到其他字段(id, num, d, h)的值，这是为了保证对于df中已有的数据，newRow的相应行是一样的，后续union的时候可以去掉重复数据：

输出：

这样，每个category下都有了最小时间和最大时间的数据了。

再用和之前一样的方法：

此时df3.count()就是70行啦！

如果我们想要计算每个category的每一个时间点的前后1小时这个时间段（一共3个小时）的平均num，就可以这么做：

注意这里要partitionBy，也就是分区计算，不然会出现两个category的时间混在一起被计算。

输出：

Window是一个很有用的函数，可以用于取想要的窗口数据。

上述代码中的rowsBetween是指从当前行算起(当前行是第0行)，某两行之间的窗口，比如这里是-1和1，也就是当前行的前一行和后一行之间的这三行。

还有一个方法是rangeBetween(x,y)，是指当前行的某个字段，比如这里的num，取这个字段某个区间的那些数据，即num值处于[num+x, num+y]这个区间的那些行。

参考资料：

https://stackoverflow.com/questions/42411184/filling-gaps-in-timeseries-spark

PreviousPysparkNextSQL

Last updated

Was this helpful?